Für die Diagnostik der Färsenmastitis spielt die klinische Euter- und Sekretuntersuchung eine zentrale Rolle. Bei Tieren, die noch nicht gekalbt haben, sollte das Sekret nur überprüft werden, wenn die klinische Untersuchung des Euters Veränderungen ergeben hat.
Bei Färsen vor der Geburt muss bei jeglicher Sekretentnahme sehr sauber gearbeitet werden: Handschuhe tragen, Hände und Zitzen vor Entnahme desinfizieren, nach der Beprobung Zitzen mit einem wirksam desinfizierenden Dippmittel (als Tierarzneimittel zugelassen) dippen.
Liegen bei Färsen vor der Geburt klinische Befunde vor, sollte eine Sekretprobe entnommen und bakteriologisch untersucht werden (Erregernachweis + Resistenztest).
Nach der Kalbung ist die Untersuchung einer Milchprobe auch bei Verdachtsfällen zur Abklärung des Vorliegens einer subklinischen Mastitis möglich.
Zusätzlich zur Anzüchtung des beteiligten Mastitiserregers sollte auch ein Resistenztest durchgeführt werden. Milch- und Sekretproben können auch mittels PCR (Polymerase-Kettenreaktion) untersucht werden. Bei dieser Methode wird kein Erreger angezüchtet, wie bei der kulturellen Untersuchung, sondern es wird Erbmaterial von Erregern nachgewiesen. Bei dieser Methode ist im Anschluss kein Resistenztest möglich und es unterbleibt in der Regel aus Kostengründen eine Untersuchung aller vier Viertel.
Sekretproben von Färsen vor der Kalbung können mit weiteren Methoden (Leitfähigkeitsmessung, Bestimmung von pH-Wert, Zellzahl, Chloridwert u.a.) kaum untersucht werden, weil im Trächtigkeitsverlauf ständig andere Bedingungen vorliegen.